Big Data -medicinen identifierar lämplig kemoterapi för cancer

Datorprogram länkar data för att bestämma bästa möjliga behandling för patienter
I framtiden kan medicin dra stor nytta av datorprogram som länkar information om patienter med aktiva ingredienser. På så sätt bestäms bästa möjliga terapi. Eftersom framgången för en behandling beror på många enskilda faktorer. Till exempel kan en viss kemoterapi fungera bra i en patient men inte i någon annan. Lösningen ska leverera "stora data".

Hitta den optimala aktiva ingrediensen med Big Data
Buzzword "stora data" orsakar många människor rädsla. Eftersom förmågan att samla, lagra och länka enorma datamängder medför många risker ur ett dataskyddssynpunkt. På medicinområdet kan speciella datorprogram som länkar patientdata till aktuell forskning, terapier och relaterade fallhistorier öka värdet genom att identifiera den optimala behandlingen för patienten. Men integritetsförespråkare varnar för att sådana uppgifter kan användas till exempel av arbetsgivare och försäkringar till nackdel för de drabbade. Med tanke på de snabba framstegen inom området "Big Data" sammankallade etikkommittén ett årsmöte under mottot "Big Data in Medicine" vid Hasso Plattner Institute (HPI) för Software Systems Engineering i Potsdam. Under de senaste två dagarna diskuterade medicinska och IT-experter framstegen och nackdelarna med de nya möjligheterna.

Stora data mot cancer. Bild: vege - fotolia

"Drug Response Analyzer", som redan används vid Charité Medical Clinic för hematologi, onkologi och tumörimmunologi, introducerades också. Programmet syftar till att hjälpa läkare att välja den mest lämpliga kemoterapi för tumörer i mun, struphuvud, struphuvud, näsa och hals inom några minuter. Systemet utvecklades av matematiker, datorforskare och HPI-chef Christoph Meinel och chef för HPI-programmet "E-Health", Matthieu Schapranow. Programmet betraktar ämnen, kombinationer av cytotoxiner och även antikroppsterapier som specifikt ingriper i cellsignalvägar.

"Stora data" kan hjälpa läkaren avsevärt för att hitta den optimala behandlingen
Hittills måste onkologer, bland annat på grundval av patientens historia och genomkännetecken hos tumören samt ta hänsyn till internationella studieresultat och behandlingsplaner från riktlinjerna, delvis arbetar Sisyphus för att hitta den optimala behandlingen. Med "Drug Response Analyzer" vill HPI-forskarna väsentligt påskynda processen. Bland annat länkar "höghastighetsdatabasen" data om gener och proteiner från tumören, på signaleringsvägarna i cellerna liksom på dess reaktion på de olika aktiva substanserna. Dessutom läggs alla tillgängliga vetenskapliga publikationer om ämnet kontinuerligt till databasen.

"Cancerforskare kommer också att kunna identifiera relationer mellan varianter i patienternas genetiska smink och effekten av droger på dem", förklarade Meinel. "Vi kombinerar data från historiska fall för att hjälpa till att välja rätt behandling för akuta patienter", tillägger Shapranov. "En matematisk modell utvärderar data från olika patienter och möjliggör därigenom en prognos om individuellt svar från en enskild patient till ett specifikt läkemedel i realtid."

Även om endast data från cirka 40 patienter med huvud och nackcancer lagras i systemet, är de omfattande. Endast de befolkningsbaserade studierna ger hittills stora datainsamlingar. "Epidemiologi levererar alltid stor data", förklarar läkare och folkhälsoexpert Reinhard Busse från Tekniska Universitetet i Berlin till "Tagesspiegel". Han ser ny teknik som en möjlighet att näta och använda dem ännu mer effektivt. (Ag)