Massiv ersättning av multidrugsresistenta patogener mellan människor, husdjur och vilda djur

Att omvärdera förekomsten och överföringen av multidrugsresistenta patogener
Utbytet av patogener mellan människor, husdjur och vilda djur har en betydande inverkan på spridningen av antibiotikaresistens, enligt resultaten av en internationell studie som involverar forskare från Free University of Berlin och Robert Koch-institutet (RKI). Forskarna publicerade sina studieresultat i tidningen "PLoS Genetics".

, Fann forskarna att "en världsomspännande förekommande, multiresistent ESBL-producerande E. coli-variant överföres i stor utsträckning mellan människor, husdjur och vilda djur," enligt meddelandet om RKI. Det här är vad analyserna av patogenfamiljen träd avslöjade. Utbytet mellan de olika arterna har därför ett signifikant inflytande på spridningen av multidrugsresistenta patogener.

Forskare fann att multirestiella patogener cirkulerar mellan människor, vilda djur och husdjur. (Bild: JackF / fotolia.com)

Stamtavla analyser är oumbärliga för infektionskontroll
Utöver de forskare under ledning av Alan McNally av Nottingham Trent University har inkluderat Sebastian Gunther och Catherine Schaufler från Free University of Berlin och ordföranden för Robert Koch-institutet, Lothar H. Wieler, deltog i studien. Med hjälp av en ny bioinformatisk metod kunde forskarna representera patogenens stamtavla i en tidigare oöverträffad hög upplösning. Sådana "stamtavla analys (fylogenetisk analys) är väsentliga för att fortsätta utvecklingen, distribution och överföring av patogener och antibiotikaresistens och förbättra infektionskontroll", rapporterar RKI.

Patogenerna cirkulerar mellan människor, djur och husdjur
I den aktuella studien analyserade det internationella forskargruppen utbytet av så kallade ESBL-producerande E. coli-bakterier mellan människor, husdjur och boskap. Forskare har under en tid sagt att "patogenerna - och de ärftliga egenskaper som gör att resistensen är möjlig i första hand - cirkulera mellan människor, djur och miljö", säger RKI. Ett exempel på detta är de multidrugsresistenta ESBL-producerande E. coli-bakterierna, vilka bildar speciella bakterieenzymer (så kallade Extended Spectrum Beta-Lactamases, ESBL) och sålunda inaktiverar olika antibiotika.

Analyser av kärngenomet såväl som tillhörande och regulatoriskt genom
Mer än 200 isolat av en särskild ESBL-producerande E. coli-variant (sekvens typ 131; ST131), som härrörde från olika länder och värdar, analyserades av forskarna. För sin studie kombinerade de för första gången den detaljerade analysen av kärngenomet med analysen av tilläggs- och reglergenomet, rapporterar RKI. Genomet beskriver helheten av all ärftlig information av en organism och kärngenomet förekommer hos alla representanter för en art. Dessutom finns det ytterligare gener som kan variera, vilket i sin helhet kallas accessionsgenomet. Dessutom kan bakterier "kontrollera deras genom på ett målinriktat sätt" och "de områden som är ansvariga för detta kallas det regulatoriska genomet", förklarar RKI.

Titta på patogenernas utveckling
Kombinationen av analysen av alla tre genomregioner möjliggjorde för forskarna, enligt deras eget uttalande, en uppfattning med oöverträffad resolution i utvecklingen och distributionen av dessa patogener. I princip blir "molekylär övervakning, den fullständiga undersökningen av patogengener, och analysen av utveckling och spridning vid infektionskontroll allt viktigare", säger RKI. Multidrugsresistenta gramnegativa bakterier (MRGN) hotar i allt högre grad medicinska framsteg inom human och veterinärmedicin. En viktig förutsättning för molekylär övervakning är kraftfulla sekvenser och bioinformatikerens kompetens. (Fp)