Att bättre känna igen smittsamma sjukdomar och rädda liv

Ny metod för diagnos av infektionssjukdomar
Varje år är smittsamma sjukdomar orsaken till miljontals dödsfall över hela världen, med en stor del av dessa infektioner orsakade av så kallade biofilminfektioner, som hittills är svåra att diagnostisera, rapporterar German Heart Center Berlin. Med en ny metod kan de diagnostiska alternativen - och därmed behandlingsalternativen - förbättras betydligt här i framtiden.

Infektionssjukdomar är bland de 10 största orsakerna till dödsfall i Europa och många av dessa sjukdomar orsakas av så kallade biofilminfektioner. Diagnosen är hittills extremt svår i sådana fall. I samarbetsprojektet iSOLID, som finansieras av Tyska federala ministeriet för utbildning och forskning (BMBF), ska "snabb och tillförlitlig upptäckt av sådana infektioner med hjälp av digital bilddiagnostik" nu undersökas. Rekommendationer för lämpliga terapier är också syftet med samarbetsprojektet.

Bakterier kan samlas i så kallade biofilmer på olika punkter i kroppen och leda därefter till allvarliga infektionssjukdomar. Diagnosen av dessa biofilminfektioner är hittills extremt svår. (Bild: royaltystockphoto / fotolia.com)

Biofilminfektioner är särskilt svåra att känna igen
I det gemensamma projektet iSOLID (integrerade lösningar för Infection Detection) biofilm mitten av tyska Heart Center Berlin, Fraunhofer Institute for Integrated Circuits IIS, HB Technologies AG och Chili GmbH arbetar tillsammans på nya lösningar inom diagnostik av biofilminfektioner. Med hjälp av digital bilddiagnostik ska infektionerna diagnostiseras snabbare och säkrare. Biofilminfektionerna är ansvariga för en betydande andel svåra infektionssjukdomar, men hittills finns det inga lämpliga diagnostiska metoder för deras detektion och riktade terapi, rapporterar tyska Heart Center Berlin.

FISH-metod för detektering av bakterier
Som en diagnostisk metod, forskarna använda den så kallade "fluorescens in situ hybridisering" (FISH), som är baserad på fluorescensmärkta DNA-sonder, och enligt experterna kombinerar fördelarna med molekylärbiologi, fluorescensmikroskopi och histologi. Sålunda görs den specifika diagnosen infektionssjukdomar som går tillbaka till biofilmer. "Tack vare FISH-studien är biofilmer rutinmässigt mikroskopiskt synliga och detekterbara för första gången. Annette Moter från German Heart Center Berlin. Med metoden kan bakterierna som är involverade i infektionen detekteras och identifieras, så att en specifik behandling kan initieras i rätt tid, fortsätter experten. En snabb och specifik upptäckt av patogener är avgörande för rätt val av antibiotikabehandling.

Utveckling av nya förebyggande och behandlingsmetoder
Fastän FISH-metoden redan är känd bygger detta på mycket stora mängder bilddata, vars analys är komplicerad och komplex. I det nuvarande gemensamma projektet ska därför en digital metod för bildanalys för automatisk detektion och kvantifiering av mikroorganismer utvecklas. Syftet med projektet är också "arbetsflödesintegrering och provhanteringslösning för kvantitativ analys av biofilmer för utveckling av nya förebyggande och behandlingsmetoder". Med hjälp av en intuitiv bildkommunikation och arkivsystem (PACS) ska alla relevanta bildfiler lagras och bearbetas snabbt och säkert, rapporterar tyska Heart Center Berlin.

Först är det nu planerat att testa de önskade metoderna inom ramen för iSOLIDs samarbetsprojekt på kliniska vävnadsprover och också att utvärdera motsvarande arbetsflöde som en del av en diagnostisk studie. Därefter ska strukturella möjligheter skapas för att "rutinmässigt använda FISH-förfarandet nationellt och internationellt och därigenom stänga ett gap i diagnosen infektionssjukdomar", rapporterar forskarna. (Fp)